Đại diện Phòng Thanh tra – Kiểm tra 9 cho biết hóa đơn điện tử (HĐĐT) áp dụng thí điểm từ tháng 1.2021 và thực hiện chính thức từ tháng 7.2022. Quá trình triển khai đem lại nhiều lợi ích cho người nộp thuế, cơ quan thuế. Tuy nhiên cũng xảy ra nhiều vụ án mua bán hóa đơn với quy mô lớn trong phạm vi cả nước gây thiệt hại cho ngân sách nhà nước. Thực tiễn đặt ra phải quản lý rủi ro với HĐĐT. Công tác quản lý rủi ro HĐĐT có 3 nội dung, đó là quản lý doanh nghiệp (DN) sử dụng HĐĐT, tình hình triển khai và chức năng cảnh báo tự động; rà soát chênh lệch HĐĐT và tờ khai thuế giá trị gia tăng (GTGT).
Đối với quản lý DN sử dụng HĐĐT, Phòng Thanh tra – Kiểm tra 9 đang quản lý 2.930 DN với số thu 6.600 tỉ, đạt 110% dự toán và tăng 13% so với cùng kỳ năm trước. Trong năm 2024, Phòng tiếp nhận 192 DN mới thành lập, thực hiện rà soát các DN đang quản lý cũng như DN mới thành lập nhưng không kê khai hoặc không liên lạc được, thư trả về. Qua xác minh địa chỉ và bằng các nghiệp vụ, Phòng ban hành thông báo rời địa chỉ kinh doanh cho 133 DN, trong đó 79 DN vừa mới thành lập trong năm 2024. Ngoài ra, còn có những rủi ro đáng chú ý, đó là cùng một địa chỉ email nhưng có rất nhiều DN được thành lập mới. Chẳng hạn, địa chỉ mail 7979@gmail.com sở hữu 80 DN, trong đó cơ quan thuế đã đóng mã số thuế hơn 60 DN, số còn lại không được xuất hóa đơn và tiến hành các thủ tục đóng mã số thuế.
Lại có tình trạng, DN mới thành lập nhưng xuất hóa đơn giá trị lớn, kê khai đầu vào đầu ra không có chênh lệch để tránh chạy hệ thống rủi ro cảnh báo của cơ quan thuế bằng cách ghi rất chung chung, không ghi mặt hàng gì nhưng giá trị rất lớn. Đồng thời, một số DN thành lập công ty ma qua CCCD thu được từ những vùng xa xôi, hẻo lánh. Phòng tiếp nhận một số thông tin tố giác của một số cá nhân là bị sử dụng CCCD thành lập DN. Sau khi tiếp nhận, cơ quan thuế thực hiện khóa hóa đơn, thông báo cho Sở Kế hoạch và Đầu tư để xử lý theo quy định.
Tại hội nghị, Cục Thuế TP.HCM cho biết trong 11 tháng đầu năm 2024 đã rà soát và xử lý các DN sử dụng 168.746 hóa đơn bất hợp pháp, tổng số tiền thuế đã điều chỉnh, truy thu và phạt là 726,8 tỉ đồng, giảm khấu trừ 191,2 tỉ và giảm chi phí 2.386 tỉ đồng. Thực hiện đối chiếu dữ liệu tờ khai thuế GTGT, qua đó đã yêu cầu được 7.088 người nộp thuế có hành vi kê khai sai hóa đơn với số thuế GTGT đầu ra và đầu vào thực hiện điều chỉnh là 3.670 tỉ đồng. Còn đối với vận hành chức năng cảnh báo tự động xuất hóa đơn vượt ngưỡng rủi ro, qua đó đã xử lý đối với 9.769 người nộp thuế có hệ số K vượt ngưỡng cảnh báo.
Trong năm 2024, tổng thu nội địa cơ quan thuế trên địa bàn đạt 373.572 tỉ đồng, đạt 106,2% dự toán năm, tăng 14,1% so với cùng kỳ năm 2023; nếu loại trừ khoản thu hồi vốn của các doanh nghiệp nhà nước thì ước thu được 358.463 tỉ đồng, đạt 101,9% dự toán, tăng 9,5% so với cùng kỳ năm 2023.